COVID : Indicateurs de suivi

L’objectif des indicateurs de suivi est de piloter au plus près l’évolution de la pandémie.

L’indicateur retenu ici est volontairement simple pour être robuste et parlant pour les décideurs.
Nous avons choisi un estimateur Rx du fameux Ro, correspondant au nombre de personnes contaminées par un individu.
Nous suivons l’évolution de cet estimateur jour après jour pour percevoir les évolutions à venir et anticiper les rebonds de l’épidémie.
Plusieurs méthodes permettent de calculer ce Ro, à partir de modèles par compartiments ou à partir d’évolution des contaminations. Des hypothèses sont à chaque fois nécessaire.
Formellement, ce ratio correspond au taux de transmission dans la population au début de l’épidémie lorsqu’elle n’ a pas d’immunité ou qu’elle est faible.
Notre première hypothèse est donc que l’immunité de groupe varie peu sur une période courte. Il est donc possible de calculer notre Rx sur cette période, suffisamment longue pour fournir un résultat précis, suffisamment courte pour ne pas enregistrer de variations trop importantes de la structure épidémiologique de la population. Nous avons retenu une “fenêtre” de calcul de 14 jours.
Ces 14 jours correspondent à une durée approximative de la contagiosité d’un individu.
Ce qui signifie qu’un individu contaminé au début de notre fenêtre sera contagieux pendant toute sa durée.
Pour chaque date, nous calculons un modèle (une régression exponentielle) sur les 14 jours précédents et à partir de ce modèle, nous évaluons un taux de doublement du nombre de contamination puis l’estimation du Ro.